海神的女儿波妞从深海出逃玩耍，却被困在玻璃瓶里冲到岸上，碰巧被住在岸边悬崖的宗介救出，两人因此相识。但是波妞的父亲——魔法师藤本，认为人类世界肮脏丑陋，强行把波妞带回海里。面对父亲的阻挠、席卷小镇的海

神秘的怪兽突然出现在现代并袭击人类，而人类只能被它们恣意翻弄，为了查明真相，科学家番场宗介以“影鳄”这一关键字开始了追寻……